Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZQ7

BC048562, cDNA sequence BC048562, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048562Q80ZQ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC048562Q80ZQ7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms