Protein–RNA interactions for Protein: Q80YG3

Klhdc1, Kelch domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc1Q80YG3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhdc1Q80YG3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc1Q80YG3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms