Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Kdm5bQ80Y84 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Kdm5bQ80Y84 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms