Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pcsk9Q80W65 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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