Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms