Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc29Q80VM3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc29Q80VM3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms