Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab3gap1Q80UJ7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rab3gap1Q80UJ7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms