Protein–RNA interactions for Protein: Q80TV8

Clasp1, CLIP-associating protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clasp1Q80TV8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clasp1Q80TV8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clasp1Q80TV8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Clasp1Q80TV8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clasp1Q80TV8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clasp1Q80TV8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clasp1Q80TV8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clasp1Q80TV8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Clasp1Q80TV8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Clasp1Q80TV8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Clasp1Q80TV8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Clasp1Q80TV8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Clasp1Q80TV8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Clasp1Q80TV8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clasp1Q80TV8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms