Protein–RNA interactions for Protein: Q80TN7

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Length 2,359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav3Q80TN7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nav3Q80TN7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nav3Q80TN7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nav3Q80TN7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nav3Q80TN7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nav3Q80TN7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nav3Q80TN7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nav3Q80TN7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Nav3Q80TN7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Nav3Q80TN7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Nav3Q80TN7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Nav3Q80TN7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nav3Q80TN7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms