Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna12Q80SS5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna12Q80SS5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifna12Q80SS5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms