Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cdc42bpbQ7TT50 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc42bpbQ7TT50 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms