Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClmQ7TSN2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms