Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1cQ7TSF0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms