Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSD4

Tbata, Protein TBATA, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbataQ7TSD4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TbataQ7TSD4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TbataQ7TSD4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TbataQ7TSD4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TbataQ7TSD4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TbataQ7TSD4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TbataQ7TSD4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TbataQ7TSD4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TbataQ7TSD4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TbataQ7TSD4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TbataQ7TSD4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms