Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf18Q7TS55 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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