Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms