Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms