Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd1l2Q7TN88 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms