Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyfip1Q7TMB8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyfip1Q7TMB8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms