Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcl2Q78Y63 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms