Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TwistnbQ78WZ7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TwistnbQ78WZ7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TwistnbQ78WZ7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TwistnbQ78WZ7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TwistnbQ78WZ7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TwistnbQ78WZ7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TwistnbQ78WZ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TwistnbQ78WZ7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms