Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sys1Q78S06 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms