Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms