Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed3Q78IS1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmed3Q78IS1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed3Q78IS1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms