Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cd3eapQ76KJ5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms