Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spcs3Q6ZWQ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spcs3Q6ZWQ7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms