Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms