Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ino80Q6ZPV2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ino80Q6ZPV2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms