Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b4Q6Q477 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b4Q6Q477 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms