Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4aQ6Q473 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca4aQ6Q473 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms