Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms