Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc85bQ6PDY0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc85bQ6PDY0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms