Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Vstm2lQ6PDS0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm2lQ6PDS0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms