Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms