Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim37Q6PCX9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim37Q6PCX9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim37Q6PCX9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim37Q6PCX9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim37Q6PCX9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim37Q6PCX9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim37Q6PCX9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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