Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Herc4Q6PAV2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 255.7 ms