Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BcrQ6PAJ1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcrQ6PAJ1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms