Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl2Q6PA06 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms