Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms