Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sik3Q6P4S6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sik3Q6P4S6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik3Q6P4S6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik3Q6P4S6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sik3Q6P4S6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms