Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Podnl1Q6P3Y9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms