Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r3aQ6P2K6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r3aQ6P2K6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r3aQ6P2K6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r3aQ6P2K6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r3aQ6P2K6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r3aQ6P2K6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r3aQ6P2K6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r3aQ6P2K6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp4r3aQ6P2K6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms