Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1Q6NXH3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms