Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc3bQ6NWW9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms