Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpsf6Q6NVF9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms