Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HelbQ6NVF4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HelbQ6NVF4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HelbQ6NVF4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms