Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2surpQ6NV83 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms