Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RragbQ6NTA4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms