Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SphkapQ6NSW3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SphkapQ6NSW3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SphkapQ6NSW3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms