Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
B4galnt3Q6L8S8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4galnt3Q6L8S8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms